ICBO

Sobre o programa

Workshops

Tutoriais

O número de vagas para as oficinas é limitado. Preencha este formulário para indicar suas opções de workshop/tutorial.


Painel Alma Sírio-Libanês



Tema: Aplicação de Ontologias na Área da Saúde

Coordenação: Dra. Beatriz de Faria Leão

Lista de painéis:


Demonstração de Software

Desenvolvimento de ontologia em recursos FHIR com a plataforma Fast Evidence Interoperability Resources (FEvIR)

Apresentador: Caue Monaco

Link da ferramenta: https://fevir.net

Imagem para fundo de tela

Como sugestão de fundo de tela nos softwares de participação virtual, indica-se o seguinte papel de parede.

Programação

NOTA: Este é um cronograma preliminar e pode ser alterado até a data da conferência, dependendo dos trabalhos e pôsteres aceitos, além da disponibilidade de palestrantes e apresentadores.

Agenda 28 de Agosto 28 de Agosto 30 de Agosto 31 de Agosto 1º de Setembro
Manhã 08:00-08:30 Registro e networking
08:30-09:00
Workshops e tutoriais
W1
(Parte 1)		 T1
(Parte 1)
Workshops e tutoriais
T3
(Parte 1)		 W3
(Parte 1)		 T4
(Parte 1)
Sessão de abertura Palestra 3:
Barry Smith		 Palestra 4:
Renata Guizzardi
09:00-10:00 Palestra 1:
Mathias Brochhausen
10:00-10:15 Coffee-break Coffee-break
10:15-10:30
Workshops e tutoriais
W1
(Parte 2)		 T1
(Parte 2)
Workshops e tutoriais
T3
(Parte 2)		 W3
(Parte 2)		 T4
(Parte 2)
Sessão 2 de Apresentação de artigos* Sessão 4 de Apresentação de artigos*
10:30-10:45 Coffee-break
10:45-11:45 Sessão 1 de Apresentação de artigos*
11:45-13:30 Almoço
Tarde 13:30-15:00
Workshops e tutoriais
W1
(Parte 3)		 T2
(Parte 1)		 T5
(Parte 1)
Workshops e tutoriais
T3
(Parte 3)		 W4
(Parte 1)		 W2
(Parte 1)
Palestra 2:
Maurício Barcellos		 Painel Alma Sírio-Libanês Sessão 5 de Apresentação de artigos*
15:00-15:15 Coffee-break Flash talks** Sessão de Encerramento
15:15-15:30
Workshops e tutoriais
W1
(Parte 4)		 T2
(Parte 2)		 T5
(Parte 2)
Workshops e tutoriais
T3
(Parte 4)		 W4
(Parte 2)		 W2
(Parte 2)
Sessão de pôster e demonstração de software
Recepção de boas-vindas
15:30-15:45 Coffee-break
15:45-17:45 Sessão 3 de Apresentação de artigos*
Noite 18:30-21:30 Jantar Social

* Apresentações de Artigos em Paralelo do ICBO e Ontobras

** Flash talks para pôsteres / demonstrações de software

NOTA: As apresentações de artigos do ICBO e Ontobras ocorrerão em paralelo.


O número de vagas para workshops e tutoriais é limitado devido à capacidade das salas físicas e virtuais.
Para melhor acomodar os participantes, por favor, preencha este formulário para indicar suas opções de workshop/tutorial.

Detalhamento da agenda

Temos o prazer de fornecer a você o cronograma detalhado de cada sessão, incluindo os respectivos trabalhos que serão apresentados. A seguir, encontre as informações que delineiam a sequência das sessões e as apresentações dos trabalhos correspondentes.

Segunda, 28 de Agosto, 2023 (café da manhã por conta própria)

Manhã
                
                    08:00 - 08:30 Registro e networking
                    08:30 - 10:00 W1: Ontologies for Infectious and Immune-mediated Disease Data Science (Full-day)
                    08:30 - 10:00 T1: Natural Language Processing Tutorial for Biomedical Text Mining (Half-day)
                
  
                    10:00 - 10:15 Coffee-break 
                
                    
                    10:15 - 11:45 W1: Ontologies for Infectious and Immune-mediated Disease Data Science (Full-day)
                    10:15 - 11:45 T1: Natural Language Processing Tutorial for Biomedical Text Mining (Half-day)
            
  
                    11:45 - 13:30 Almoço
Tarde
                
                    13:30 - 15:00 W1: Ontologies for Infectious and Immune-mediated Disease Data Science (Full-day) 
                    13:30 - 15:00 T2: OBO Foundry Tutorial: Introduction to workflows and best practices for ontology development (Half-day)  
                    13:30 - 15:00 T5: Ontology-Driven Conceptual Modeling with UFO, gUFO, and OntoUML (Half-day)
                
   
                    15:00 - 15:15 Coffee-break  
                
                    
                    15:15 - 17:45 W1: Ontologies for Infectious and Immune-mediated Disease Data Science (Full-day) 
                    15:15 - 17:45 T2: OBO Foundry Tutorial: Introduction to workflows and best practices for ontology development (Half-day)   
                    15:15 - 17:45 T5: Ontology-Driven Conceptual Modeling with UFO, gUFO, and OntoUML (Half-day)

Terça, 29 de Agosto, 2023 (café da manhã por conta própria)

Manhã
                
                    08:00 - 08:30 Registro e networking
                    08:30 - 10:00 T3: BFO as a top-level ontology for information systems modeling (Half-day)
                    08:30 - 10:00 W3: 12th Vaccine and Drug Ontology Studies (VDOS) 2023 Workshop (Half-day) 
                    08:30 - 10:00 T4: Machine Learning with Ontologies (Half-day)
                
   
                    10:00 - 10:15 Coffee-break  
                
                    
                    10:15 - 11:45 T3: BFO as a top-level ontology for information systems modeling (Half-day)
                    10:15 - 11:45 W3: 12th Vaccine and Drug Ontology Studies (VDOS) 2023 Workshop (Half-day) 
                    10:15 - 11:45 T4: Machine Learning with Ontologies (Half-day)  
            
  
                    11:45 - 13:30 Almoço
Tarde
                
                    13:30 - 15:00 T3: BFO as a top-level ontology for information systems modeling (Half-day) 
                    13:30 - 15:00 W4: FOHTI-23 (FAIR Ontology Harmonization and Trust Data Interoperability) (Half-day) 
                    13:30 - 15:00 W2: The 7th International Cells in Experimental Life Science Workshop, CELLS 2023 (Half-day) 
                
  
                    15:00 - 15:15 Coffee-break 
                
                    15:15 - 17:45 T3: BFO as a top-level ontology for information systems modeling (Half-day) 
                    15:15 - 17:45 W4: FOHTI-23 (FAIR Ontology Harmonization and Trust Data Interoperability) (Half-day)  
                    15:15 - 17:45 W2: The 7th International Cells in Experimental Life Science Workshop, CELLS 2023 (Half-day)

Quarta, 30 de Agosto, 2023 (café da manhã por conta própria)

Manhã
                
                    08:00 - 08:30 Registration and networking
                    08:30 - 09:00 Opening Session 
            
            
     Palestra 1:

                09:00 - 10:30 Mathias Brochhausen: IMPROVING ONTOLOGIES TO FOSTER AI IN BIOMEDICINE 
            
  
                10:30 - 10:45 Coffee-break  
            
                
                    10:45 - 11:45 Papers presentations Session 1 (Parallel ICBO and Ontobras papers presentations) 
                    
 
    10:45 - 11:10 Version control for interdependent ontologies: challenges and first propositions [journal]
                  Authors: Paul Fabry, Adrien Barton, Jean-Francois Ethier
    11:15 - 11:40 Improving the classification of cardinality phenotypes using collections
                  Authors: Sarah Alghamdi, Robert Hoehndorf - Virtual Presenter
  
                    11:45 - 13:30 Almoço
Tarde
                
     Palestra 2:

                13:30 - 15:00 Maurício Barcellos: A BFO-BASED AUTHORITY FRAMEWORK FOR HEALTHCARE CORPORATIONS 
            
                
                    15:00 - 15:15 Flash talks (for posters/software demos)
                    15:15 - 17:45 Poster and Software Demo session and Welcome reception

Quinta, 31 de Agosto, 2023 (café da manhã por conta própria)

Manhã 
                
                    08:00 - 08:30 Registration and networking
            
                
     Palestra 3:

                08:30 - 10:00 Barry Smith: USE OF AI IN MEDICAL RESEARCH, AND THE ROLE OF ONTOLOGY 
            
  
                10:00 - 10:15 Coffee-break  
            

                10:15 - 11:45 Papers presentations session 2 (Parallel ICBO and Ontobras papers presentations) 
                
 
    10:15 - 10:40 An Extendible Realism-Based Ontology for Kinship 
                  Authors: Michael Rabenberg, Anuwat Pengput and Werner Ceusters - Virtual Presenter
    10:45 - 11:10 The OntoWoH Ontology - a Women's Health Reference Ontology Detailing the Fragment of Climacteric and Menopause
                  Authors: Cilenir Carla de Carvalho, Andreia Soprani dos Santos, Silvia Das Dores Rissino, Susana Bubach 
                  and Maria Das Graças Da Silva Teixeira - Attendee In Person
    11:15 - 11:40 Ontology-based representation and analysis of conditional vaccine immune responses using Omics data
     
                  Authors: Anthony Huffman, Edison Ong, Tim Brunson, Nasim Sanati, Jie Zheng, Anna Maria Masci, Guanming Wu and Yongqun He - Virtual Presenter              
                
  
                    11:45 - 13:30 Almoço
Tarde
                
                    13:30 - 15:30 Alma Sírio-Libanês Panel 
            
  
                15:30 - 15:45 Coffee-break  
            
                
                    15:45 - 18:10 Papers presentations session 3(Parallel ICBO and Ontobras papers presentations)  
                    
 
    15:45 - 16:10 The potential of ontologies for the empirical assessment of machine learning techniques in operational oceanography processes 
                  Author: Enrique Wulff - Virtual Presenter
    16:15 - 16:40 An Application of Natural Language Processing and Ontologies to Electronic Healthcare Records in the Field of Gynecology
                  Authors: Amanda Damasceno de Souza, Fernanda Farinelli, Eduardo Ribeiro Felipe, Armando Sérgio de Aguiar Filho 
                  and Mauricio Barcellos Almeida - Attendee In Person
    16:45 - 17:10 Leveraging Biomedical Ontologies to Boost Performance of BERT-Based Models for Answering Medical MCQs
                  Authors: Sahil and P Sreenivasa Kumar - Virtual Presenter
    17:15 - 17:40 Principles of ontology-based annotation of clinical narratives
                  Authors: Stefan Schulz, Warren Del-Pinto, Lifeng Han, Markus Kreuzthaler, Sareh Aghaei Dinani and Goran Nenadic - Attendee In Person
    17:45 - 18:10 Concrete Names for Complex Expressions in Ontologies: A Survey of Biomedical Ontologies
                   Authors: Christian Kindermann and Martin Georg Skjæveland - Virtual Presenter
Noite
                
                    18:30 - 20:45 Social Dinner

Sexta, 1 de Setembro 1, 2023 (café da manhã por conta própria)

Manhã
                
                    08:00 - 08:30 Registration and networking
            
                
     Palestra 4:
    
                08:30 - 10:00 Renata Guizzardi: ETHICAL REQUIREMENTS FOR AI SYSTEMS 
            
                
                    10:00 - 10:15 Coffee-break	 
            
                                    
                    10:15 - 11:55 Papers presentations session 4(Parallel ICBO and Ontobras papers presentations) 
                    
 
    10:15 - 10:40 Using ontology embeddings with deep learning architectures to improve prediction of ontology concepts from literature
                  Authors: Pratik Devkota, Somya Mohanty and Prashanti Manda - Virtual Presenter 
    10:45 - 11:10 KOSonto: an ontology for knowledge organization systems, their constituents, and their referents 
                  Authors: Jean Noël Nikiema, Fleur Mougin, Vianney Jouhet and Stefan Schulz - Attendee In-Person
    11:15 - 11:30 Beyond the Goods-Service Continuum 
                  Authors: Peter Koch and Barry Smith - Virtual Presenter
    11:35 - 11:50 Ontology-based Integration of Consumer Data and EHR Systems to Fill Gaps in Social Determinants of Health Data 
                  Authors: S. Clint Dowland, Melody Greer, Sudeepa Bhattacharyya and Mathias Brochhausen - Attendee In-Person
                
  
                    11:55 - 13:30 Almoço
Tarde
                
                    13:30 - 15:15 Papers presentations 5 (Parallel ICBO and Ontobras papers presentations) 
                    
 
    13:30 - 13:55 An Ontology for Obsessive-Compulsive Disorder with Reuse and Enrichment 
                  Authors: Areej Muhajab, Alia Abdelmoty and Athanasios Hassoulas - Virtual Presenter
    14:00 - 14:25 An ontology for mammography screening recommendation 
                  Authors: Cindy Acuña, Yasmine Anchén, Edelweis Rohrer and Regina Motz - Attendee In-Person
    14:30 - 14:55 Exploring the Use of Ontology Components for Distantly-Supervised Disease and Phenotype Named Entity Recognition 
                  Authors: Sumyyah Toonsi, Senay Kafkas and Robert Hoehndorf - Virtual Presenter                    
                
 
                    15:00 - 15:15 Sessão de encerramento

Transporte (Hotel-Conferência-Hotel)

Por favor, chegue ao local de embarque designado 5 minutos antes do horário programado, pois o ônibus não poderá esperar na rua.
Detalhes sobre horários e locais de paradas:

Para assistir às palestras da conferência ICBO-Ontobras 2023, utilize o novo link com a senha: